Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd5D6MZJ6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms