Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf217D3YYI7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf217D3YYI7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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