Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SafbD3YXK2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SafbD3YXK2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms