Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smok3bC0HKC9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms