Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms