Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11cB4XVP9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms