Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms