Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms