Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms