Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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