Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms