Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trgv2A2J008 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms