Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtcflA2APF3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms