Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdccag3A2AIW0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms