Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39aA2ACP1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms