Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700023F06RikA2AB62 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms