Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc173A0JLY1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc173A0JLY1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms