Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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