Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trav4-2A0A075B638 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trav4-2A0A075B638 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trav4-2A0A075B638 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trav4-2A0A075B638 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trav4-2A0A075B638 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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