Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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