Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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