Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PHACTR1Q9C0D0 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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