Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms