Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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