Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms