Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms