Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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