Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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