Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms