Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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