Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SKIV2LQ15477 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SKIV2LQ15477 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SKIV2LQ15477 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SKIV2LQ15477 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SKIV2LQ15477 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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