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| RUNX3 | Q13761 | AC036103.1-201 | ENST00000563846 | 823 nt | TSL 5 BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYP4A43P-201 | ENST00000568156 | 121 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC119751.4-201 | ENST00000507498 | 357 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC087672.2-201 | ENST00000522498 | 429 nt | TSL 2 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099520.2-201 | ENST00000523745 | 567 nt | TSL 3 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL359232.1-201 | ENST00000556361 | 442 nt | TSL 3 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL591424.2-201 | ENST00000617023 | 128 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354821.1-201 | ENST00000617598 | 809 nt | TSL 3 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009269.6-201 | ENST00000621778 | 588 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL357559.1-201 | ENST00000622228 | 274 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL773545.4-201 | ENST00000637262 | 310 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VGLL4-219 | ENST00000638314 | 93 nt | TSL 5 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL513478.4-201 | ENST00000641636 | 310 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSPA8P19-201 | ENST00000505359 | 1517 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ALS2CR12-201 | ENST00000286190 | 1769 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCDH15-218 | ENST00000437009 | 6804 nt | TSL 5 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ASAH1-265 | ENST00000637922 | 2297 nt | TSL 5 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLIC2-202 | ENST00000369449 | 2655 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAX1BP1-213 | ENST00000543117 | 3365 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLS3-209 | ENST00000539310 | 3037 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATG12-208 | ENST00000509910 | 4333 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CAPS2-206 | ENST00000409799 | 1859 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PREPL-205 | ENST00000409411 | 4725 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DGKI-204 | ENST00000453654 | 12928 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DOCK7-202 | ENST00000340370 | 6731 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01109-201 | ENST00000603837 | 3081 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADAM28-201 | ENST00000265769 | 7052 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NEK11-207 | ENST00000508196 | 1938 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLET1-201 | ENST00000338832 | 1215 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR34B-201 | ENST00000385076 | 84 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104297.1-201 | ENST00000393779 | 870 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IL6-203 | ENST00000401651 | 539 nt | TSL 2 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | F10-AS1-201 | ENST00000424635 | 417 nt | TSL 5 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL512658.1-202 | ENST00000433486 | 400 nt | TSL 3 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL357520.1-201 | ENST00000441557 | 453 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL360089.1-201 | ENST00000442260 | 436 nt | TSL 5 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SETD6P1-201 | ENST00000444575 | 317 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MOB1AP2-201 | ENST00000446060 | 614 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRDX3P3-201 | ENST00000447765 | 522 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SUN3-208 | ENST00000453192 | 801 nt | TSL 5 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00377-201 | ENST00000456588 | 657 nt | TSL 5 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018635.1-201 | ENST00000468292 | 1030 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS26P28-201 | ENST00000470806 | 348 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SAR1B-204 | ENST00000502539 | 708 nt | TSL 5 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |