Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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