Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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