Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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PTP4A2Q12974 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PTP4A2Q12974 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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PTP4A2Q12974 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PTP4A2Q12974 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PTP4A2Q12974 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PTP4A2Q12974 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PTP4A2Q12974 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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