Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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FOXD4Q12950 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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FOXD4Q12950 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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FOXD4Q12950 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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FOXD4Q12950 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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FOXD4Q12950 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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FOXD4Q12950 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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