Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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USP29Q9HBJ7 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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USP29Q9HBJ7 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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USP29Q9HBJ7 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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USP29Q9HBJ7 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP29Q9HBJ7 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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