Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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