Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PUM3Q15397 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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