Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SRSF5Q13243 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SRSF5Q13243 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms