Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
LRRTM2O43300 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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