Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-1B6SEH8 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms