Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CLN3Q13286 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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