Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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FOXD4Q12950 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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FOXD4Q12950 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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FOXD4Q12950 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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