Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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