Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms