Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17190V9GX38 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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