Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt16Q9Z2K1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms