Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccl27Q9Z1X0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl27Q9Z1X0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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