Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clic1Q9Z1Q5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms